原材料及勞工成本的增加：成本的上升乃工程施工行業面臨的挑戰之一。原材料成本的增加受到各種因素的影響，如全球商品價格、供求關系的波動及政府法規及政策的變化。此外，不斷上漲的勞工成本亦給工程施工行業帶來了挑戰。技術工人需求量大，導致彼等工資穩步上漲。因此，雇主必須提供更具競爭力的薪金以吸引技術工人，這對建筑公司構成了挑戰。
勞工短缺：技術工人的短缺進一步加劇挑戰，原因為尋找合格工人變得更加困難及競爭更激烈。由于工程施工周期長，工作條件復雜，許多年輕人選擇其他行業的工作，導致建筑勞工中年輕工人短缺。此外，隨著生育率的下降，人口紅利正在逐漸減少。對于勞動密集型的工程施工行業而言，勞工短缺進一步加劇工程施工行業的老齡化。勞工短缺影響項目的完成效率及質量，亦可能導致更高的建筑成本。因此，勞工短缺乃工程施工行業發展面臨的挑戰之一。
技術升級：綠色建筑的發展對研發、設計、工程施工、以及運營及維護等整個工程施工過程提出很高的要求。例如，發展綠色建筑乃工程施工行業的未來趨勢之一，實現綠色建筑目標需要先進的工業制造技術、生產技術等。然而，大多數公司的技術仍然相對落后，對工程施工行業而言，于未來加強必要的技術改造成為一個挑戰。
